Революционный прорыв в биологии: представлена Evo 2 - крупнейшая ИИ-модель для работы с геномами

Arc Institute совместно с NVIDIA, Стэнфордским университетом, Калифорнийским университетом в Беркли и Калифорнийским университетом в Сан-Франциско представил Evo 2 — крупнейшую на сегодня ИИ-модель для биологии:

Основные характеристики:

• Обучение на основе 9.3 триллионов нуклеотидов из 128 000 геномов.
• Покрытие всех доменов жизни: от бактерий до человека.
• Два варианта модели: 7 миллиардов и 40 миллиардов параметров.
• Способность обрабатывать последовательности длиной до 1 миллиона нуклеотидов.

Технологические достижения:

• Архитектура StripedHyena 2 обеспечивает трехкратное увеличение скорости обработки.
• Работа без предварительной подготовки или выравнивания последовательностей.
• Открытый исходный код и доступ к данным.
• Интеграция с платформой NVIDIA BioNeMo.

Возможности применения:

1. Анализ генетических заболеваний:
   • Прогнозирование патогенности мутаций с точностью свыше 90%.
   • Эффективная работа с генами, такими как BRCA1 (рак молочной железы).
   • Поддержка анализа как кодирующих, так и некодирующих участков ДНК.
2. Генетическое проектирование:
   • Генерация человеческих митохондриальных геномов.
   • Создание бактериальных геномов.
   • Проектирование эукариотических хромосом.
   • Управление доступностью хроматина.
3. Исследования и разработка лекарственных препаратов:
   • Моделирование виртуальных клеток.
   • Изучение взаимодействий между генотипом и окружающей средой.
   • Идентификация новых терапевтических целей.

Обеспечение безопасности:

• Исключение патогенных организмов из тренировочного набора данных.
• Ограничения на использование модели для опасных патогенов.
• Этап этического контроля с участием экспертов.

Инструментальная экосистема:

• Веб-интерфейс Evo Designer для удобной работы с моделью.
• Средства интерпретации от GoodfireAI.
• Интеграция с NVIDIA для ускорения вычислительных процессов.

Уникальные особенности Evo 2:

1. Универсальность: Модель охватывает весь спектр живых существ.
2. Скорость: Значительное ускорение биомедицинских исследований.
3. Доступность: Открытость кода способствует широкому использованию.
4. Точность: Достижение лучших показателей без дополнительной настройки.
5. Масштабируемость: Возможность создания специализированных приложений.

Перспективы:

• Ускоренная разработка новых лекарственных средств.
• Повышенная точность диагностики наследственных болезней.
• Более точные методы генной терапии.
• Прогресс в области синтетической биологии.
• Создание «магазина приложений» для биологических инструментов.

Evo 2 обещает революционизировать биологию и медицину благодаря своим мощным возможностям и открытому подходу.